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第109回日本選手権10000m（4月12日、熊本・えがお健康スタジアム／金栗記念選抜中長距離と併催）、同混成競技（7月12～13日／岐阜・岐阜メモリアルセンター長良川競技場）、同リレー（混成競技と併催）の出場資格が1月15日に発表された。いずれも優先順に前回優勝者・チーム（10000mはクロスカントリー優勝者も含む／女子は5000mとの選択）と、10000mと混成競技は日本グランプリシリーズ20024種目別ランキング上位6位、および申込資格記録を満たした競技者（直近開催の地域選手権3位以内の競技者の中で当該種目申込資格記録上位3名の競技者が優先）に出場資格が与えられる。加えて、10000mの資格記録は男子が10000m28分00秒00、10km28分00秒、女子は10000m32分25秒00、10km32分25秒および5000m15分40秒00、5km15分40秒に設定された。ターゲットナンバー（TN）は男女ともに30。混成のTNは男女各24。資格記録は男子7050点、女子4950点。リレーについては、前回優勝チームを含む資格記録上位27チームに出場資格が与えられる。記録の有効期間は25年4月1日～6月11日。なお、地域選手権上位チームについては、有効期間内に開催が少ないため、今大会は除外された。